Старая школа пипетирования и технологии нового века
Команда исследователей из института Вайтхед модернизировала один из самых старых и самых утомительных научных методов исследования — пипетирование. В стремлении помочь научному сообществу группа установила общедоступную систему, которой можно пользоваться совершенно бесплатно.
Названная iPipet, система преобразовывает айпэд или любой планшетный компьютер в устройство, регистрирующее сложные протоколы пипетирования. Пользователи iPipet могут также делиться своими проектами друг с другом, обмениваясь информацией через научно-исследовательское сообщество. Система, созданная сотрудником лаборатории института Вайтхед Феллоу Янива Эрлич, подробно описана в статье журнала «Нэйчере Методс».
Эрлич говорит, что сегодняшние эксперименты часто полагаются на методы высокой пропускной способности, которые объединяют большие количества образцов со сложной пипеточной конструкцией. Ошибки пипетирования могут привести к неудачному эксперименту. Казалось бы, что для такой работы было бы логичнее использовать обрабатывающих жидкость роботов, но они очень дорогие и требуют квалифицированного персонала.
«Мы нуждались в альтернативе дорогостоящим роботам для корректного составления протоколов пипетирования, — говорит Эрлич. — Это особенно актуально при работе с человеческими образцами, которые часто находятся в ограниченном количестве».
iPipet освещает отдельные лунки стандартных 96- или 384-луночных планшетов, размещенные в верхней части экрана, руководимые пользователями посредством передачи образцов или реактивов от источника до пластин назначения согласно определенным формам. Пользователи создают свои собственные протоколы в файлах формата Microsoft Excel и загружают их на веб-сайт iPipet. В меню сайта включены разнообразные демонстрации и обучающее видео.
Насколько же хорошо iPipet выполняет работу? Ученые решили провести сравнительный эксперимент работы iPipet и обрабатывающего жидкость робота. iPipet обработал почти 3 000 фиксированных образцов приблизительно за семь часов. Робот же за это время выполнил только половину работы.
«Система iPipet — открытый источник, — говорит Эрлич. — Мы хотим максимизировать пользу для общества и позволить далее развивать этот новый человеко-машинный интерфейс для биологических экспериментов».